近日，北京市農(nóng)林科學(xué)院生物所在Frontiers in Plant Science期刊（影響因子5.753/Q1）發(fā)表了題為“The Construction forbid Exploration of a Comprehensive MicroRNA Centered Regulatory Network in Foxtail Millet （Setaria italica L.）”的文章。

 

　　在植物生長發(fā)育和響應(yīng)環(huán)境應(yīng)答過程中，MicroRNA（miRNA）及其靶基因發(fā)揮重要作用。目前，通過遺傳學(xué)等方法對植物中單個miRNA的功能解析越來越多，但是谷子miRNA在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用特點以及與轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控關(guān)系仍然未見報道。

 

　　該研究針對谷子拔節(jié)前期和灌漿前期這2個谷子生長發(fā)育關(guān)鍵時期，開展谷子miRNA深度測序、降解組和轉(zhuǎn)錄組等多組學(xué)聯(lián)合分析，構(gòu)建了以前饋環(huán)路（Feed-Forward Loop）為基準(zhǔn)單元的谷子miRNA為中心的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，其中包括36個轉(zhuǎn)錄因子家族、266個核心轉(zhuǎn)錄因子、136個miRNA和2417個下游靶基因以及他們之間的調(diào)控關(guān)系。

 

　　下一步，利用該研究篩選獲得的禾本科特有和谷子特有的核心miRNA，綜合前期谷子重測序相關(guān)數(shù)據(jù)、谷子種質(zhì)資源表型數(shù)據(jù)，挖掘和解析谷子千粒重等優(yōu)異品質(zhì)性狀的關(guān)鍵基因及其調(diào)控途徑。

 

　　我院生物所職工鄧楊和客座研究生張浩林為本文共同第一作者，我院張杰偉副研究員、魏建華研究員和楊效曾研究員為共同通訊作者，論文的第一通訊單位為北京市農(nóng)林科學(xué)院。該研究得到國家重點研發(fā)計劃、我院創(chuàng)新能力建設(shè)項目和國家重點實驗室開放基金的資助。