肉雞是提供禽肉產(chǎn)品的重要經(jīng)濟(jì)動(dòng)物。近年來，集約化養(yǎng)殖模式在不斷發(fā)展數(shù)量、產(chǎn)量以及出欄速度的過程中，由于增重速度過快及飼養(yǎng)空間的限制，導(dǎo)致肉雞脛骨軟骨發(fā)育不良（Tibial Dyschondroplasia, TD）的發(fā)病率大幅度增加。據(jù)統(tǒng)計(jì)，TD在世界范圍內(nèi)發(fā)病率可達(dá)10%-30%，由于其多表現(xiàn)為亞臨床癥狀而常被忽視。TD不僅抑制肉雞生長(zhǎng)，還造成肉質(zhì)減退，給養(yǎng)禽業(yè)造成了巨大經(jīng)濟(jì)損失。由于當(dāng)前對(duì)TD的發(fā)病機(jī)制不清楚，目前還沒有預(yù)防和治療TD的特異藥物，因此亟待尋找針對(duì)TD的有效分子標(biāo)記物。
近日，四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)科學(xué)院王彥教授團(tuán)隊(duì)在國際知名期刊《Ecotoxicology and Environmental Safety》（中科院Top期刊，IF=7.129），發(fā)表了題為《綜合分析福美雙誘導(dǎo)雞脛骨軟骨發(fā)育不良中差異表達(dá)的mRNA和非編碼RNA及其相互調(diào)控機(jī)制》（Comprehensive analysis of differently expression mRNA and non-coding RNAs, and their regulatory mechanisms on relationship in thiram-induced tibial dyschondroplasia in chicken）的研究論文。該研究立足我國對(duì)家禽養(yǎng)殖抗病育種的需求，首次對(duì)TD肉雞中差異表達(dá)的mRNA、miRNA、circRNA和lncRNA進(jìn)行了注釋，并構(gòu)建了lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。
該研究以天府肉雞為研究材料，通過建立TD模型，對(duì)TD肉雞和健康肉雞的脛骨軟骨組織進(jìn)行了全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，獲得了差異表達(dá)的mRNAs 141個(gè)，miRNAs 10個(gè)，lncRNAs 23個(gè)、circRNAs 35個(gè)。研究發(fā)現(xiàn)，這些差異表達(dá)的mRNA和非編碼RNA主要富集在TGF-β、MAPK、Hippo等與骨形成相關(guān)的信號(hào)通路，推測(cè)這些差異基因可能與TD的發(fā)生有關(guān)。同時(shí)，研究人員對(duì)這些差異表達(dá)基因進(jìn)行了ceRNA分析，發(fā)現(xiàn)諸如gga-miR-1737和gga-miR-3540等關(guān)鍵分子在TD發(fā)生中具有重要調(diào)控作用。這一研究結(jié)果為肉雞TD發(fā)生機(jī)制提供了新的理論見解，也為TD的防治和治療提供了有效的分子標(biāo)記。
該研究論文以動(dòng)科學(xué)院2021級(jí)博士研究生陸余香為第一作者，2020級(jí)碩士研究生姜雨汝為共同第一作者，王彥教授為通訊作者。這一研究得到了國家自然科學(xué)基金和四川省育種攻關(guān)項(xiàng)目的資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2022.113924
