有機食品和綠色食品的區(qū)別有以下幾點：
一是有機食品強調(diào)的是來自有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的產(chǎn)品，而綠色食品強調(diào)的是出自最佳生態(tài)環(huán)境的產(chǎn)品。發(fā)展有機農(nóng)業(yè)的重要目的是改造由于現(xiàn)代化農(nóng)業(yè)而遭到破壞的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)環(huán)境，通過轉(zhuǎn)換培育健康、平衡、充滿活力的可持續(xù)發(fā)展的生產(chǎn)系統(tǒng)。因此兩者在出發(fā)點上有本質(zhì)區(qū)別，即發(fā)展有機食品的目的是改造、保護(hù)環(huán)境，而綠色食品首先是利用沒有污染的生態(tài)環(huán)境。
二是有機食品和綠色食品生產(chǎn)、加工標(biāo)準(zhǔn)不同。有機食品生產(chǎn)過程強調(diào)以生態(tài)學(xué)原理建立多種種養(yǎng)結(jié)合、循環(huán)再生的完整體系，盡量減少對外部物質(zhì)的依賴，禁止使用人工合成的農(nóng)用化學(xué)品，而綠色食品標(biāo)準(zhǔn)中卻允許使用高效低毒的化學(xué)農(nóng)藥，允許使用化學(xué)肥料，不拒絕基因工程方法和產(chǎn)品。
三是管理方法不同。有機食品強調(diào)生產(chǎn)全過程的管理，其理論依據(jù)是有好的過程必定有好的結(jié)果，而綠色食品非常注重生產(chǎn)環(huán)境和產(chǎn)品的檢測結(jié)果。在認(rèn)證管理上，兩者也有區(qū)別，有機食品要求每年都要接受檢查認(rèn)證，綠色食品一次認(rèn)證可用幾年。
