在物理性污染方面，指在工業(yè)化的加工過程中，來自食品原料、產(chǎn)地環(huán)境、加工設(shè)備等造成的各種物理性因素污染，包括原料混雜、金屬碎屑、石塊沙粒等，也包括人工混雜的各種物理性雜質(zhì)、異物等。
在化學(xué)性污染方面，指工業(yè)化的加工過程中，化學(xué)合成物質(zhì)對加工食品質(zhì)量安全產(chǎn)生的危害。如，加工過程中一些化學(xué)色素、化學(xué)添加劑的不適當(dāng)使用。不適宜的加工工藝，使食物中有害的化學(xué)物質(zhì)增加。加工設(shè)備、包裝材料等含有或食品接觸面沾有有害有毒化學(xué)物質(zhì)，對加工食品的質(zhì)量安全造成危害。
在生物性污染方面，指工業(yè)化加工過程中或來自食品原料和包裝材料的各類生物性污染，對加工食品質(zhì)量安全產(chǎn)生的危害。包括食品原料的生物性質(zhì)量劣變；產(chǎn)地環(huán)境、加工設(shè)備接觸面、操作人員的各種生物性污染，如致病性細(xì)菌、病毒以及某些毒素等；包裝新材料對加工食品造成的生物性污染，以及因保質(zhì)期的不適當(dāng)標(biāo)注或超過保質(zhì)期，造成加工食品的生物性劣變。