為了與一般的普通食品相區(qū)別，綠色食品實行標志管理。綠色食品標志由特定的圖形來表示。綠色食品標志圖形由三部分構成：上方的太陽、下 方的葉片，和菇蕾。標志圖形為正圓形，意為保護、安全。整個圖形描繪了一幅明踞陽光照耀下的和諧生機，告訴人們綠色食品是出自純凈、良好生態(tài)環(huán)境的安全、 無污染食品，能給人們帶來蓬勃的生命力。綠色食品標志還提醒人們要保護環(huán)境和防止污染，通過改善人與環(huán)境的關系，創(chuàng)造自然界新的和諧。
綠色食品標志商標作為特定的產品質量證明商標，已由中國綠色食品發(fā)展中心在國家工商行政管理局注冊，從而使綠色食品標志商標專用權受《中華人民共和國商標 法》保護，這樣既有利于約束和規(guī)范企業(yè)的經濟行為，又有利于保護廣大消費者的利益。綠色食品商標已在國家工商行政管理局注冊的有以下四種形式：
