日本對農產品質量安全相當重視，其法律法規(guī)也較為健全，1999年日本國會通過了有關糧食、農業(yè)、農村的基本法，提出了有關提高食品安全性、確保食品品質、重視消費者需求的條款。農產品質量安全方面的立法包括食品衛(wèi)生、農產品質量、投入品（農藥、獸藥、飼料添加劑等）、動物防疫、植物保護等5個方面。
日本直接對社會發(fā)生行政執(zhí)法行為的部門只有兩家，即農林水產省和厚生勞動?。蝗毡巨r產品質量安全標準主要分兩類，一類是安全衛(wèi)生標準，包括動植物疫病、有毒有害物質殘留等；一類是質量標準。日本厚生勞動省頒布了2000多個品種、1000多個殘留限量標準；農林水產省已頒布7類、351種品質規(guī)格標準。
為了具體落實基本法，日本國會通過了《流通三法》，即《特定農產品加工經營改善臨時措施法部分修正的法律》、《批發(fā)市場法以及食品流通結構改善促進法部分條款修正的法律》和《關于農林物資規(guī)格化及其品質正確標記部分修正的法律》（簡稱修正JAS法）。
據(jù)報道，修正JAS法實施后，農林物資規(guī)格調查會經過多次討論，公布了有機農產品（食品）的特定JAS規(guī)格，修正JAS法規(guī)定，有機農業(yè)的栽培條件是，果樹和茶在收獲前3年、蔬菜和稻米等在播種前2年不使用農藥和化學肥料，但轉基因作物和有放射線照射的作物除外。與此同時，被許可的有關肥料、土壤改良資料、農藥、調節(jié)用的生產資料也有相應的規(guī)定。
另外，規(guī)定在加工食品中，有機農產品的比重必須占95％以上，對可以使用的食品添加劑和藥劑也有相應的規(guī)定。在標簽上，必須標有“有機農產品”、“有機栽培農產品”、“有機××”等字樣。如果是處于轉換期間的，應在名稱的前面或后面標有“轉換期間”。
在規(guī)定必須標明有機農產品（食品）規(guī)格的同時，農產品（食品）是否確實按照所規(guī)定的標準進行栽培的，必須接受第三者的認定和證明。根據(jù)修正JAS法的規(guī)定，被農林水產大臣指定的登記認定機關，可以對食品制造商、生產者（生產工程管理者）和進口商的農產品（食品）進行認證。并且規(guī)定接受認證的業(yè)主有標記的義務。關于認定機關審查（認定）者的資格，規(guī)定大學畢業(yè)生必須有從事有機農產品生產3年以上經驗，高中畢業(yè)生必須有4年以上經驗、并且在農業(yè)生產有指導、檢查、試驗研究方面的經驗。沒有學歷的，則必須有5年以上從事農業(yè)生產的經驗。
日本對進口農產品、畜產品以及食品類的檢疫防疫制度非常嚴格，對于入境農產品，首先由農林水產省下屬的動物檢疫所和植物防疫所從動植物病蟲害角度進行檢疫。同時，由于農產品中很大部分用作食品，在接受動植物檢疫之后，還要由日本厚生勞動省下屬的檢疫所對具有食品性質的農產品從食品角度進行衛(wèi)生防疫檢查等。
日本推廣身份證制度，至少有三個目的：一是為了食品安全。農產品有了身份證，消費者一看便知是不是本國蔬菜，是不是綠色食品，有沒有農藥殘留，新鮮不新鮮。二是突出特點，在激烈的農產品競爭中以質取勝。
由于氣候和土壤的不同，日本各地在蔬菜水果方面都有自己的特產，如岐阜縣的甜瓜，加賀市的蔬菜等，只要身份證上標明產地，立刻就會出現(xiàn)品牌效應。即使價錢高一些人們也會接受。三是利用身份證保護本國農產品。由于日本農產品價格太貴，日本人基本上已經接受來自外國的農產品，特別是中國蔬菜，日本農產品在一定程度上受到了沖擊。（中國漁網）
