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中科院微生物所解析出耐藥基因在細(xì)菌間的傳播網(wǎng)絡(luò)和規(guī)律

   2016-09-21 中國(guó)科學(xué)報(bào)8290
核心提示:近日,中科院微生物所朱寶利課題組在細(xì)菌耐藥基因組學(xué)研究領(lǐng)域取得進(jìn)展。該研究首次以基因組學(xué)大數(shù)據(jù)為依托,解析了耐藥基因在細(xì)
    近日,中科院微生物所朱寶利課題組在細(xì)菌耐藥基因組學(xué)研究領(lǐng)域取得進(jìn)展。該研究首次以基因組學(xué)大數(shù)據(jù)為依托,解析了耐藥基因在細(xì)菌間的傳播網(wǎng)絡(luò)和規(guī)律,對(duì)深入認(rèn)識(shí)細(xì)菌耐藥性的進(jìn)化、細(xì)菌耐藥的形成機(jī)制等具有重要意義。相關(guān)成果已在線發(fā)表于《應(yīng)用與環(huán)境微生物學(xué)》,并將以“封面故事”形式發(fā)表。
 
    近年來(lái),隨著“超級(jí)細(xì)菌”的不斷出現(xiàn),問(wèn)題日益突出。細(xì)菌具有多種耐藥機(jī)制,由大量耐藥基因所編碼,然而,具有高風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)的可移動(dòng)性的耐藥基因在細(xì)菌及人體和動(dòng)物腸道菌群間的傳播網(wǎng)絡(luò)及傳播驅(qū)動(dòng)力并未得到完全揭示。
 
    研究人員全面分析后發(fā)現(xiàn),可移動(dòng)性耐藥基因主要存在于4個(gè)細(xì)菌門(mén)當(dāng)中的790個(gè)細(xì)菌種之中,其豐度和轉(zhuǎn)移頻率在變形菌門(mén)中顯著富集。這些耐藥基因在細(xì)菌間的近期轉(zhuǎn)移形成了一張巨大的網(wǎng)絡(luò),由703個(gè)細(xì)菌種、16859個(gè)種間配對(duì)所組成。對(duì)該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行解析,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌個(gè)體間耐藥基因的轉(zhuǎn)移由細(xì)菌種屬進(jìn)化關(guān)系所主導(dǎo),又同時(shí)受制于生態(tài)屏障;這一規(guī)律同樣適用于耐藥基因在人體和動(dòng)物腸道細(xì)菌群體水平上的轉(zhuǎn)移。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),41個(gè)人體和動(dòng)物腸道菌群間相互轉(zhuǎn)移的耐藥基因中的33個(gè)存在于多種人體病原細(xì)菌中。
 
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