香港中文大學(xué)林漢明團(tuán)隊(duì)和華大基因等多家機(jī)構(gòu)合作,完成全球首個(gè)野生大豆高質(zhì)量參考基因組解析。該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優(yōu)化栽培大豆品種提供了重要依據(jù)。相關(guān)成果近日在線(xiàn)發(fā)表于《自然—通訊》。
“大豆的基因組含有大量重復(fù)區(qū),組裝時(shí)困難重重。我們整合了幾種最新測(cè)序方法產(chǎn)生大量數(shù)據(jù),才最終把問(wèn)題解決。”林漢明告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》。
他帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)在2010年率先完成了31個(gè)野生大豆和栽培大豆的測(cè)序;隨后在2014年首次成功利用基因測(cè)序方法,獲得野生大豆耐鹽基因,并成功應(yīng)用產(chǎn)生新大豆耐逆品種。
在最新研究中,團(tuán)隊(duì)針對(duì)野生大豆W05,應(yīng)用多種最新測(cè)序方法產(chǎn)生大量數(shù)據(jù),最終組裝得到染色體級(jí)別的參考基因組。
“野生大豆基因組組合可在比較基因組和進(jìn)化研究中幫助尋找重要基因,最終幫助改良栽培大豆性狀,并研發(fā)出高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、耐逆大豆。”林漢明說(shuō)。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41467-019-09142-9