7月12日,西北農(nóng)林科技大學(xué)旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點實驗室研究人員在《基因組生物學(xué)》上發(fā)表研究論文,揭示出六倍體小麥遺傳多樣性來源于頻繁地與野生小麥的種內(nèi)雜交以及與更遠(yuǎn)緣野草的種間雜交。
作為國際小麥基因組測序聯(lián)盟成員,西北農(nóng)林科技大學(xué)研究人員于2016年底率先獲得了內(nèi)部共享、尚未發(fā)表的六倍體小麥參考基因組信息,對來自全世界的93個野生小麥、六倍體農(nóng)家種和主栽品種開展全基因組重測序。面對高重復(fù)的多倍體基因組分析難題,他們通過開發(fā)新的分析流程,建立了全面的小麥變異組信息,揭示了全球最廣泛種植的作物——六倍體小麥各亞基因組的遺傳變異、群體內(nèi)和群體間的遺傳分化程度、馴化和改良階段的受選擇信號等全方位的變異系譜和變異來源。
這一首個大規(guī)模全基因組重測序研究,提供了目前數(shù)量最多、覆蓋最全的六倍體小麥及其野生祖先的基因組變異集合,篩選出來自多個野生小麥群體和遠(yuǎn)源物種的大量基因滲入,其中一些滲入片段在群體中的出現(xiàn)頻率隨著馴化或改良顯著增加。頻率改變并與已知數(shù)量性狀連鎖區(qū)域的重疊,提示這些片段在馴化和改良過程中可能扮演重要角色。
該研究將為了解小麥起源、進化和馴化歷史,克服小麥遺傳資源同質(zhì)化,促進小麥遺傳改良提供重要的數(shù)據(jù)資源。
相關(guān)論文信息:http://doi.org/10.1186/s13059-019-1744-x