近日，豬遺傳育種創(chuàng)新團隊繪制了涵蓋豬胚胎發(fā)育全期骨骼肌基因組染色質開放區(qū)域精細圖譜，鑒定了調節(jié)肌肉發(fā)育的順式調控元件及相關基因，為更好地研究豬胚胎骨骼肌發(fā)育相關基因的調控動力學奠定了基礎。相關研究成果發(fā)表在《畜牧與生物技術雜志（Journal of Animal Science and Biotechnology）》上。
據(jù)團隊執(zhí)行首席張龍超博士介紹，豬胚胎肌肉發(fā)育主要集中在兩個生長波，即胚胎期35-60天，初級纖維形成；胚胎期54-90天，次級纖維生成。發(fā)育過程中，大量轉錄因子通過與開放的靶基因DNA序列結合來調控基因轉錄的發(fā)生，進而控制骨骼肌發(fā)育進程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質開放性尚不清晰，豬經濟性狀分子機理解析及基因組育種技術創(chuàng)新受到制約。為攻克這一瓶頸問題，研究人員以大白豬為研究對象，利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學研究技術，獲得了包含45、70和100胚齡時期骨骼肌表觀遺傳調控數(shù)據(jù)，并在三個胚胎時期分別鑒定出21,638、35,447和60,181個染色體開放區(qū)域。研究還發(fā)現(xiàn)數(shù)個調控肌肉發(fā)育相關基因的轉錄因子以及大量轉錄阻遏物，為豬功能基因組及性狀調控機制研究提供了重要參考。
該研究得到中國農業(yè)科學院創(chuàng)新工程、國家生豬產業(yè)技術體系的資助。
原文鏈接https://doi.org/10.1186/s40104-021-00577-z
