近日，中國農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所經(jīng)濟作物真菌病害流行監(jiān)測與防控創(chuàng)新團隊在國際知名期刊《微生物學波譜（Microbiology Spectrum）》上在線發(fā)表題為“Functional genomics and comparative lineage-Specific region analyses reveal novel insights into race divergence in Verticillium dahliae ”的研究論文，首次鑒定出大麗輪枝菌3號生理小種無毒基因，并研發(fā)了鑒定大麗輪枝菌3號生理小種的分子檢測技術。
由大麗輪枝菌引起的黃萎病嚴重威脅全球農(nóng)作物生產(chǎn)安全，年均直接經(jīng)濟損失數(shù)十億美元，極難防控。傳統(tǒng)上，依據(jù)番茄對大麗輪枝菌的抗性分為3個生理小種，1號和2號生理小種無毒基因已經(jīng)得到鑒定并應用于田間病原分子流行監(jiān)測，但3號生理小種無毒基因一直未被發(fā)現(xiàn)，嚴重制約了對3號生理小種與寄主互作機制的理解和分子檢測技術的研發(fā)。
本研究在系統(tǒng)解析大麗輪枝菌3個生理小種基因組及其遺傳變異的基礎上，發(fā)現(xiàn)大麗輪枝菌3個生理小種的信號調控因子（轉錄因子）發(fā)生了顯著分化，同時各個生理小種相對于其他2個生理小種均有基因家族發(fā)生擴增；通過對3個生理小種基因組特異基因集的篩選與遺傳學驗證，鑒定出3號生理小種無毒基因（ VdR3e ），并在此基礎上研發(fā)了大麗輪枝菌3號生理小種分子檢測技術。相關研究拼上了大麗輪枝菌生理小種種群分化和無毒基因鑒定的重要“版圖”，也為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實踐中大麗輪枝菌生理小種監(jiān)測和寄主抗性資源挖掘與應用提供了重要的理論和技術支撐。
中國農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所經(jīng)濟作物真菌病害流行監(jiān)測與防控創(chuàng)新團隊戴小楓研究員、陳捷胤研究員和美國加州大學戴維斯分校Krishna Subbarao教授為論文的共同通訊作者，中國農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所博士后王丹為論文的第一作者，中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所劉磊副研究員參與了此項工作。該研究得到國家重點研發(fā)計劃項目、國家自然科學基金、中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程等項目的資助。
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34937170/
大麗輪枝菌3號生理小種無毒基因鑒定和分子標記開發(fā)
