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中國水產(chǎn)科學研究院珠江所在魚類種質(zhì)資源基因標記開發(fā)方面取得新進展

   2022-11-03 中國水產(chǎn)科學研究院4880
   近日,中國水產(chǎn)科學研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在魚類種質(zhì)資源基因標記開發(fā)方面取得新進展,相關成果以“FishPIE: A universal phylogenetically informative exon markers set for ray-finned fishes”發(fā)表于Cell旗下期刊《iScience》。
 
  依托國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫珠江分庫(掛靠單位中國水產(chǎn)科學研究院珠江水產(chǎn)研究所)保存的魚類基因資源和數(shù)據(jù)資源,從131種魚類基因組數(shù)據(jù)中篩選出直系同源基因,通過對31個目203個物種的PCR引物特異性和PCR擴增效率進行進一步篩選,初步開發(fā)了82個魚類通用型核基因分子標記(FishPIE),并構建了魚類60個目190個科710種魚類的系統(tǒng)發(fā)育樹,得到了與使用數(shù)百個標記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當?shù)姆直媛?。新標記的開發(fā)應用,可以實現(xiàn)對魚類種質(zhì)的快速分類和鑒定,在保障準確率的前提下,降低了現(xiàn)有技術耗時、費力、成本高的問題,同時為魚類系統(tǒng)發(fā)育提供了一種新方案,豐富了基于分子標記對魚類系統(tǒng)發(fā)育研究的基礎數(shù)據(jù)。
 
  研究工作得到國家重點研發(fā)計劃(2018YFD0900705),中國-東盟海上合作基金(CAMC-2018F))和國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(FGRC18537)等項目資助。牟希東、楊葉欣和孫金輝為共同第一作者,牟希東和中山大學馬嘉欣為共同通訊作者。
 
  原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974
 
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